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净选指中药材在切制、炮炙或调配、制剂前，均应选取规定的药用部分，除去非药用部分、杂质及霉变品、虫蛀品等，使其达到药用的净度标准。
1.清除杂质的方法有四种：挑选、筛选、风选、水选等。
2.分离和清除非药用部位：首先搞清要分离不同药用部位的有—— 莲子 心（胚芽）清心火，莲子肉补脾涩精； 麻黄 根止汗，麻黄草质茎发汗；如 白扁豆 分离种皮和种仁。 白首乌 、苦楝根、雷公藤的外皮有毒副作用也应除去。毛能刺激咽喉引起咳嗽，故应除去以消除副作用。去毛方法有 鹿茸 燎去毛茸； 枇杷 叶、 石韦 刷去毛； 骨碎补 、 狗脊 、马钱子用砂炒法烫去毛； 金樱子 挖净毛和核； 香附 撞去毛。其他操作多为去除非药用部位，以洁净药物，调配时剂量准确。要知道应去除的部位及适用的药物，以备选择。如用茎部分的药物一般须除去主根、支根、须根等，例 石斛 、 芦根 、 藕节 等。用根部的药物往往须除去残茎，如龙胆、 丹参 、 威灵仙 、 防风 。 牡丹皮 、 地骨皮 、巴戟天、 五加皮 应去木质心。 乌梅 、 山楂 ， 山茱萸 等去核取肉。 枳壳 去瓤。
3.其他加工应了解方法及适用药物。
碾捣：如矿物药 自然铜 、赭石、 龙骨 、 阳起石 ，动物甲壳 龟甲 、 牡蛎 、 瓦楞子 ，植物药 芥子 、韭菜子、 木鳖子 等。制绒：如麻黄制绒， 艾叶 制绒。拌衣：如 朱砂 拌茯神、茯苓、 远志 ，以增强宁心安神作用。 青黛 拌灯心草有清热凉肝的作用。
